Language switching

Monday, October 24, 2016

Zámrsk téměř kompletně online!

Borci ze Zámrsku dokázali zveřejnit již téměř všechny matriky online. Takže hodně štěstí s identifikací nových předků. Já už stihnul za víkend pokročit.
http://vychodoceskearchivy.cz/zamrsk/

Friday, October 14, 2016

FamilyTreeDNA naležato

  Příjemná změna se stala u společnosti FamilyTreeDNA (https://www.familytreedna.com/) - která z firem věnujících se DNA testům, nám, genetickým genealogům, naslouchá asi nejvíc. FTDNA od tohoto týdne podporuje z leva do prava orientovaný formát rodokmenů. Ten se náramně hodí pro přehledné studium mnoha generací najednou, hodně do hloubky - přesně to, co genetický genealog potřebuje při hledání společných předků ve stromech svých genetických shod. Společní předci (jak jsme si ukazovali minule) se totiž často ve stromě schovávají pěkně hluboko.

  Pro názornou ukázku, normální do teď podporovaný rodokmen vám představu o mnoha předcích rozhodně nedal:

  Kdežto dnes krásně vidíme spoustu předků najednou!


Právě tak jak to potřebujeme pro hledání společných příjmení s našimi DNA shodami... dobrá práce, FamilyTree! MyHeritage, ač jsou rodokmeny její hlavní činnost, nebyla schopná tenhle pohled dodat za celou dobu existence (i přes to, že na Geni jsou).

Takže hodně štěstí při hledání společných předků v těchhle krásných přehledných stromech. Je dobře, že alespoň některé DNA testující společnosti svým zákazníkům naslouchají (na tebe se dívám, 23andMe).

FamilyTree across the horizon

  I am sure most of you have not missed this great new feature at FTDNA already. But for the small rest of you, I wanted to make you aware, that FTDNA now supports the pedigree view. A left - to - right orientation of your family tree, that is very neat for checking a lot of ancestral generations at once. Just what a genetic genealogist needs.

  So instead of a tree looking like this:

  You now have this!

Clearly superior for quick search of that familiar surname... good job, FamilyTree! MyHeritage was not able to provide this view in all of its existence, boo.

Well good luck searching for those common ancestors in the nice pedigrees, it's great to know at least some of the companies care and listen (yes, I am looking at you in particular, 23andMe).

Wednesday, October 12, 2016

23andMe se rozvádí s MyHeritage, umožní provázat jakýkoliv strom

  Včera byla na nových fórech 23andMe publikována zpráva o konci partnerství s MyHeritage. Stalo se to velmi pravděpodobně proto, že MyHeritage vstupuje na pole genetických shod a grafů populačních směsí (admixture). Zpráva na novém fóru 23andMe: http://www.23andmeforums.com/discussion/2864/family-tree-update

Ta zajímavější část je, že nám 23andMe umožní uložit do svého profilu cestu na jakoukoliv službu.
In the future, you will be able to post a link to any family tree from another website (including MyHeritage) to your DNA Relatives profile. I’ll let you know when this functionality has been added to DNA Relatives.
To by mělo zvýšit počet lidí, kteří na 23andMe uvádějí své stromy, a to je skvělé! Snad budou lidé často používat služeb, které jsou zadarmo a dostuplné pro všechny, jako WikiTree, FamilySearch nebo Geni. Problém s nejpoužívanější Ancestry je, že neumožňuje hostům vidět stromy platicích zákazníků - na rozdíl od MyHeritage.

Celkově se snad jedná o pozitivní změnu, která bude znamenat více profilů odkazujících na rodokmeny na 23andMe.

Tuesday, October 11, 2016

23andMe divorcing MyHeritage, will allow linking to other companies

  We got a notice from 23andMe that their partnership with MyHeritage is ending. This is likely due to MyHeritage entering the DNA matching and ancestry admixture space.
Here is the link to the new forums: http://www.23andmeforums.com/discussion/2864/family-tree-update

More importantly, the community person, Rosie, mentioned that we will have the ability to link any tree to our profile.
In the future, you will be able to post a link to any family tree from another website (including MyHeritage) to your DNA Relatives profile. I’ll let you know when this functionality has been added to DNA Relatives.
This should increase the amount of available trees to some extent, which is great! Hopefully, people will be able to use the free services like WikiTree, FamilySearch or Geni. The most commonly used Ancestry service unfortunately does not let guests view family trees, as far as I know - which is worse than MyHeritage in this respect.

All in all, this should be a positive change meaning more family trees on 23andMe.

Monday, October 10, 2016

Celý genom za hubičku?

Nový startup university v Sydney nazvaný Genomix http://www.genomix.co/ začal nabízet celogenomická data s 30x pokrytím za 200 australských dolarů.

To je úžasná nabídka. Co vím, tak dnes není možné získat celý genom (ne jen exom) za míň než 1000$.

V tom musí přeci být nějaký háček! A taky že jo :) Vaše výsledky obdržíte až na konci roku 2017. A to jen v případě, že se projektu zůčastní dostatek platících zákazníku. Jedná se tedy o takovou genetickou future -  myslíte si, že cena sekvenování úplného genomu na konci roku 2017 klesne pod 200$? Nebo ani náhodou? Podle toho objednávejte, nebo nechte být.

Za sebe musím říct, že mě ta nabídka velmi láká. :D

Full genome data for a kiss?

Recently a University of Sydney social enterprise called Genomix http://www.genomix.co/ started to offer a full genome 30x coverage for 200AUS$.

This is an incredible offer. You cannot get the whole genome, not just the exome, for below 1000$ as far as I know.

The catch? Your data will be delivered end of 2017. IF enough people participate. So it's basically a future -  do you think end of 2017 price for full genome sequencing will be above 200$, below? Based on what you think, you can order or skip.

I must say I feel very tempted by this offer. :D

Začínáme

  Často jsem přemýšlel o tom, že si založím blog. Hlavně bych chtěl více vzdělat českou genealogickou komunitu v otázce genetické genealogie ale rád se budu také účastnit aktuálního anglického geneticko genealogického dění. Stává se mi, že mám myšlenku, kterou bych rád ke zrovna probíhající debatě prospěl, a blog je asi nejrozumější kanál.

  Jako své první téma jsem si vybral to, na čem by měla stát práce každého genetického genealoga. A to jeho rodokmen.

  Společnosti, u kterých si můžeme nechat otestovat svou DNA často zkreslují situaci - neustále mluví o 3rd cousins a 4th cousins - tj. o příbuzných, se kterými máme společného prapraděčka a praprababičku, respektive praprapradědečka a prapraprababičku. Protože mi české názvosloví přijde nedostatečné, bude tady na blogu používat 3tí bratranec / 4tý bratranec (ve smyslu obou pohlaví). Pokud se ovšem problematikou zabýváme hlouběji - navštivme například stránky Mezinárodní společnosti genetických genealogů: http://isogg.org/wiki/Cousin_statistics - zjistíme, že i s konzervativním odhadem počtu bratranců máme pravděpodobně více 8mých genetických bratranců než 7mých genetických bratranců než 6tých genetických bratranců, atd.


Co to znamená pro nás, genetické genealogy? Pokud chceme najít společné předky s našimi genetickými shodami, musíme seriózně zamakat na našich stromech! 8mí bratranci jsou na úrovni 7xpra, což znamená, že máme v této generaci 512 předků - a to dělá dokonce 1022 předků počítaje všechny generace od rodičů nahoru.

Vezměme si dva genetické genealogy, kteří spolu mají malou genetickou shodu. Pro rozumně spolehlivé nalezení společného předka musí mít oba ve svém stromě správně 1022 předků a porovnat je.
Takový cíl není v českých luzích a hajích nic jednoduchého. S tím jak vstupujeme do 17tého století u se u nás typicky záznamy začínají ztenčovat. I přesto bych se rád tomuhle cíli co nejvíce přiblížil a na tomhle blogu (mimo jiné) sledoval svůj postup.

Podívejme se na to první z perspektivy mých prarodičů. Nakonci to pak shrneme pro mě. Napsal jsem skript (malý počítačový prográmek), který zanalyzuje GEDCOM (počítačový způsob uložení rodokmenu) a vrátí požadované statistiky. Možná se v něm ještě nějaká muška najde, ale to že tu a tam nám eventuelně jeden člověk bude chybět, nebo přebývat nám zas tolik nevadí, pracujeme s většími čísly.

Má babička z maminčiny strany Anežka Kočíbová, *1935, gedmatch.com ID# M789839
gen#rel~DoBmatch#anc/gen#idd/gen%idd/gen#anc#idd%idd
1p190722100.00%22100.00%
2gp18731C44100.00%66100.00%
3Ggp18382C88100.00%1414100.00%
4GGgp18063C161593.75%302996.67%
53Ggp17784C323093.75%625995.16%
64Ggp05C644875.00%12610784.92%
75Ggp6C1281612.50%25412348.43%
86Ggp7C25641.56%51012724.90%
97Ggp8C51210.20%102212812.52%

Dědeček z maminčiny strany Jan Musil, *1927, gedmatch.com ID# M396921
gen#rel~DoBmatch#anc/gen#idd/gen%idd/gen#anc#idd%idd
1p189922100.00%22100.00%
2gp18601C44100.00%66100.00%
3Ggp18292C88100.00%1414100.00%
4GGgp17993C1616100.00%3030100.00%
53Ggp17674C3232100.00%6262100.00%
64Ggp5C643453.13%1269676.19%
75Ggp6C1283527.34%25413151.57%
86Ggp7C256238.98%51015430.20%
97Ggp8C512254.88%102217917.51%

Babička z tátovy strany Irena Moravcová, *1932, gedmatch.com ID# M425590
gen#rel~DoBmatch#anc/gen#idd/gen%idd/gen#anc#idd%idd
1p22100.00%22100.00%
2gp1C44100.00%66100.00%
3Ggp2C88100.00%1414100.00%
4GGgp3C161168.75%302583.33%
53Ggp4C321856.25%624369.35%
64Ggp5C642742.19%1267055.56%
75Ggp6C1281511.72%2548533.46%
86Ggp7C25672.73%5109218.04%
97Ggp8C51261.17%1022989.59%

Děda z tátovy strany Emil Krchák, *1930, žádná autozomální data
gen#rel~DoBmatch#anc/gen#idd/gen%idd/gen#anc#idd%idd
1p22100.00%22100.00%
2gp1C44100.00%66100.00%
3Ggp2C88100.00%1414100.00%
4GGgp3C161487.50%302893.33%
53Ggp4C322578.13%625385.48%
64Ggp5C642539.06%1267861.90%
75Ggp6C12832.34%2548131.89%
86Ggp7C25600.00%5108115.88%
97Ggp8C51200.00%1022817.93%

Je zřejmé, že mám před sebou ještě spoustu práce a jde i pěkně vidět, kam bych se měl zaměřit jako první - na rodinu svého dědy Krcháka.


Celkově mí vlastní předci, gedmatch.com ID# M240291 (PM240291M1, PM240291P1)
gen#rel~DoBmatch#anc/gen#idd/gen%idd/gen#anc#idd%idd
1p196022100.00%22100.00%
2gp19311C44100.00%66100.00%
3Ggp2C88100.00%1414100.00%
4GGgp3C1616100.00%3030100.00%
53Ggp4C3232100.00%6262100.00%
64Ggp5C645687.50%12611893.65%
75Ggp6C12810481.25%25422287.40%
86Ggp7C25613552.73%51035770.00%
97Ggp8C5125911.52%102241640.70%
Myslím si, že mít přes 50% známých 6xpra dědečků a prababiček je docela dobrý stav, ale určitě se dá pořádně vylepšit.


Budu se snažit publikovat mou cestu za pokrytím všech 7xpra nějakým smysluplným tempem - nejspíš parkrát za rok. Uvidíme jak mi to půjde a jak to pomůže s genetickou genealogií.

Těší mě, že jste dočetli až sem,
Kuba


P.S. Popsaná snaha, zmíněný skript pro práci s GEDCOM formátem a tenhle blog se inspirovaly tímto tématem řešeným na internetu v roce 2015. Rád bych z té doby zmíňil alespoň tento blog: http://thegeneticgenealogist.com/2015/08/11/how-much-of-your-family-tree-do-you-know-and-why-does-that-matter.